The genomics platform is a service platform open to collaboration with teams from various backgrounds. Created in 2001, it provides expertise and tools to facilitate DNA and RNA molecular analyses according to teams’ needs, the specificities of original samples, and analyses.

Key publications
  • Multi-omics comparison of malignant and normal uveal melanocytes reveals molecular features of uveal melanoma
    Cell Reports
    David Gentien, Elnaz Saberi-Ansari, Nicolas Servant, Ariane Jolly, Pierre de la Grange, Fariba Némati, Géraldine Liot, Simon Saule, Aurélie Teissandier, Deborah Bourc’his, Elodie Girard, Jennifer Wong, Julien Masliah-Planchon, Erkan Narmanli, Yuanlong Liu, Emma Torun, Rebecca Goulancourt, Manuel Rodrigues, Laure Villoing Gaudé, Cécile Reyes, Matéo Bazire, Thomas Chenegros, Emilie Henry, Audrey Rapinat, Mylene Bohec, Sylvain Baulande, Radhia M’kacher, Eric Jeandidier, André Nicolas, Giovanni Ciriello, Raphael Margueron, Didier Decaudin, Nathalie Cassoux, Sophie Piperno-Neumann, Marc-Henri Stern, Johan Harmen Gibcus, Job Dekker, Edith Heard, Sergio Roman-Roman, Joshua J. Waterfall
  • PLK1 inhibition exhibits strong anti-tumoral activity in CCND1-driven breast cancer metastases with acquired palbociclib resistance
    Nature Communications
    Elodie Montaudon, Joanna Nikitorowicz-Buniak, Laura Sourd, Ludivine Morisset, Rania El Botty, Léa Huguet, Ahmed Dahmani, Pierre Painsec, Fariba Nemati, Sophie Vacher, Walid Chemlali, Julien Masliah-Planchon, Sophie Château-Joubert, Camilla Rega, Mariana Ferreira Leal, Nikiana Simigdala, Sunil Pancholi, Ricardo Ribas, André Nicolas, Didier Meseure, Anne Vincent-Salomon, Cécile Reyes, Audrey Rapinat, David Gentien, Thibaut Larcher, Mylène Bohec, Sylvain Baulande, Virginie Bernard, Didier Decaudin, Florence Coussy, Muriel Le Romancer, Guillaume Dutertre, Zakia Tariq, Paul Cottu, Keltouma Driouch, Ivan Bièche, Lesley-Ann Martin, Elisabetta Marangoni
  • BRCAness, SLFN11, and RB1 loss predict response to topoisomerase I inhibitors in triple-negative breast cancers
    Science Translational Medicine
    Florence Coussy, Rania El-Botty, Sophie Château-Joubert, Ahmed Dahmani, Elodie Montaudon, Sophie Leboucher, Ludivine Morisset, Pierre Painsec, Laura Sourd, Léa Huguet, Fariba Nemati, Jean-Luc Servely, Thibaut Larcher, Sophie Vacher, Adrien Briaux, Cécile Reyes, Philippe La Rosa, Georges Lucotte, Tatiana Popova, Pierre Foidart, Nor Eddine Sounni, Agnès Noel, Didier Decaudin, Laetitia Fuhrmann, Anne Salomon, Fabien Reyal, Christopher Mueller, Petra Ter Brugge, Jos Jonkers, Marie-France Poupon, Marc-Henri Stern, Ivan Bièche, Yves Pommier, Elisabetta Marangoni
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Life of the team
Membres de l'équipe génomique présents lors de la formation et mis en route de la technologie Bionano
Cartographie optique Bionano
- 1 June 2020
Système Saphyr

La cartographie optique d’ADN de très haut poids moléculaire, technologie Bionano, système Saphyr, a été mis en service en juin 2020. 

Pour les dernières actualités, consulter la page “Nos pôles d’expertise/développements” 

Thomas Chenegros, Nanopore
Séquençage Nanopore
- 1 January 2022
Système MinION

Le séquençage de longs fragments d’ADN génomique par la technologie Nanopore, système MinION, a été mis en service en janvier 2022 pour compléter nos services et fournir la séquence des variants structuraux identifiés par Bionano. Pour les dernières actualités, consulter la page “Nos pôles d’expertise/développements” 

Principaux résultats du travail de thèse
Soutenance de thèse
- 10 October 2022
David Gentien

Soutenance de thèse de David Gentien, à Paris, le 10/10/2022 : Etude de la régulation de l'expression génique par une approche multi-omique dans deux modèles de mélanome uvéal agressif. 

Core for Life
Meeting Core For Life
- 20 May 2022
Vienne, 19-20/05/2022

Présentation d’une procédure pour l’identification de variants structuraux par cartographie optique Bionano puis leur caractérisation par séquençage ciblé Nanopore (Thomas Chenegros, Audrey Rapinat, David Gentien)  

Premier symposium Bionano à Curie 29-30 mai 2023
Premier symposium Bionano
- 30 May 2023
Institut Curie Paris , 30-31/05/2023
Core for Life
Séminaire Core For Life
- 2 June 2023
Zurich, 01-02/06/2023 

Présentation de l’évaluation de méthodes de préparation d’ADN de très haut poids moléculaire pour la cartographique optique et l’analyse d’échantillons complexes tels que les tumeurs pigmentées et les tumeurs du cortex (Emilie Henry, David Gentien)

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